招商銀行積極響應建設上海自貿區的國家戰略，高度重視自貿區業務發展，把上海自貿區分行打造成為全行“自貿區業務創新、離岸業務聯動”雙平臺的發展戰略。近期，招商銀行上海自貿區分行被中國（上海）自貿區管理委員會評為“2016年度中國（上海）自由貿易試驗區保稅區域優秀合作伙伴”。
分行創立伊始，搶抓自貿區特有跨境投融資政策機遇，著力增強“跨境、跨區域、跨市場”經營協同效應，全力打造在岸、離岸、自貿業務“三位一體”全牌照功能銀行。為客戶提供“境內外、離在岸、本外幣、投商行一體化”全流程的跨境金融服務。自此，客戶可在分行（一家銀行內）完成境內、境外、自貿區全部跨境交易，改變了過去經營主體分割、信息分割、市場分割和利益分割的情形，從而降低了交易成本、提高了業務效率。國內部分授信和大型跨境投資企業已將自貿分行作為其跨境金融服務的合作平臺。
為將自貿區分行地處自貿區所享有的政策優勢和三位一體的功能優勢及時觸達到企業，并積極響應總行的雙平臺戰略，自貿分行積極加大產品創新的力度，緊跟市場需求率先推出了“跨境金融自貿通”系列創新產品，為區內各類企業提供集本外幣結算、融資、投資、交易理財為一體專業化跨境服務方案。針對不同企業的需求，共設立了七大產品，其中除跨境人民幣雙向現金池為經常項下結算類產品以外，其它六項均是資本類產品，充分體現了分行在資本項下先行先試優勢。服務客戶方面，對于投行PE類客戶，自貿區分行深化合作，挖掘衍生客群，服務“客戶的客戶”等；對于上市公司類客戶，加深合作，開拓業務，全方位服務；對于新興行業類客戶，加強日常服務，增強服務客戶的粘合度。
截至2016年12月末，招行自貿區分行發放人民幣自營貸款59.33億元，較年初增長49.34億元，增幅494.06%。發放離岸折人民幣自營貸款24.74億元；共計為各類企業開立對公賬戶1797戶，其中在岸賬戶997戶，離岸賬戶528戶，FT賬戶272戶（其中FTE賬戶174戶，FTN賬戶98戶）。